军，虽然几经扩编，石山都牢牢掌控着队伍的钱粮供应、人事任免和军械物资调配等大权。
这样做的好处自不必说，但也限制了队伍快速扩张，已经不能适应急速发展的形势需要。
如今红旗营根基渐固，纵有宵小之辈结党营私，石山亦有雷霆手段将其扼杀于萌芽之时。
故而，打破旧有编制桎梏，正当其时。
此番整编，石山首开营以上军制——卫。
红旗营暂编八卫，具体情况如下：
捧月卫，都指挥使龚午，掌石山宿卫亲军，负责元帅仪仗和军官培训，编制员额三千人；
擎日卫，都指挥使常遇春，编制员额两千人；
骁骑卫，都指挥使李武，节制郭兴、冯国胜等部，编制员额两千人；
拔山卫，都指挥使胡大海，编制员额两千人；
忠武卫，都指挥使孙逊，编制员额两千五百人，镇守五河县，并负责向淮安路方向扩张；
奋武卫，都指挥使吴六斤，编制员额两千五百人，镇守怀远县，并负责向下蔡、寿春方向扩张；
抚军卫，都指挥使邵荣，编制员额两千五百人，镇守定远县，并负责向庐州路方向扩张；
镇朔卫，都指挥使傅友德，编制员额三千五百人，镇守滁州；另遣曾兴所部协防滁州，不归傅友德节制，主要负责匠作院及冶炼区安全。
另组建神机营，指挥使邓大缸，归元帅府直辖。
匠作院司业陶成道极富好奇心和求知欲，虽是士子，却不爱经书爱机巧，自从见识了碗口铳齐射的威力后，就迷上了火药和火器，这些时日，没少找“生而知之”的石山探讨火器之术。
此人天赋异禀，提出了火铳小型化的概念。
石山暂时没有这么多钢铁产能和工匠可以造火铳，便组建了匠作院，给陶成道提出了水力运用效能、弹丸飞行轨迹测算等研究课题，让他自己琢磨去。
各都指挥使虽无开府建牙之权，却能根据实战需要，向元帅府报批后，调整营、队一级编制，并组建骑队（营）及辎重营，以适应独立作战需要。
此番扩编，规模空前，战兵扩充一倍多，各卫之间还有人员交流，如抚军卫部郭子兴调入镇朔卫，补齐各卫兵员相对最简单，装备一时仅能补全直属四卫，诸卫欲成劲旅，也需很多时间整训磨合。
期间，必定会有一个相对混乱期。
石山深谙此理，趁着现行编制战斗力强悍，他便留下傅友德、郭子兴等人继续督办滁州防御体系建设，亲率大军西进，发动了对庐州路的进攻。